pollutri
/
res_levis_API
1
0
Çatalla 0
Kod Konular 0 Değişiklik İstekleri 0 Sürümler 0 Wiki Aktivite
25'ten fazla konu seçemezsiniz Konular bir harf veya rakamla başlamalı, kısa çizgiler ('-') içerebilir ve en fazla 35 karakter uzunluğunda olabilir.
5 İşleme
1 Dal
203 MiB
 
 
 
 
Dal: master
Dallar Biçim İmleri
${ item.name }
${ searchTerm } dalı oluştur
'master'den
${ noResults }
res_levis_API/.venv/lib/python3.10/site-packages/pysam/include/bcftools
root 5404e09047 first commit 3 hafta önce
..
HMM.c first commit 3 hafta önce
HMM.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
HMM.h first commit 3 hafta önce
LICENSE first commit 3 hafta önce
README first commit 3 hafta önce
abuf.c first commit 3 hafta önce
abuf.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
abuf.h first commit 3 hafta önce
bam2bcf.c first commit 3 hafta önce
bam2bcf.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
bam2bcf.h first commit 3 hafta önce
bam2bcf_edlib.c first commit 3 hafta önce
bam2bcf_edlib.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
bam2bcf_iaux.c first commit 3 hafta önce
bam2bcf_iaux.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
bam2bcf_indel.c first commit 3 hafta önce
bam2bcf_indel.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
bam_sample.c first commit 3 hafta önce
bam_sample.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
bam_sample.h first commit 3 hafta önce
bcftools.h first commit 3 hafta önce
bcftools.pysam.c first commit 3 hafta önce
bcftools.pysam.h first commit 3 hafta önce
bin.c first commit 3 hafta önce
bin.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
bin.h first commit 3 hafta önce
call.h first commit 3 hafta önce
ccall.c first commit 3 hafta önce
ccall.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
cigar_state.h first commit 3 hafta önce
cols.c first commit 3 hafta önce
cols.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
cols.h first commit 3 hafta önce
config.h first commit 3 hafta önce
consensus.c first commit 3 hafta önce
consensus.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
convert.c first commit 3 hafta önce
convert.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
convert.h first commit 3 hafta önce
csq.c first commit 3 hafta önce
csq.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
dbuf.h first commit 3 hafta önce
dist.c first commit 3 hafta önce
dist.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
dist.h first commit 3 hafta önce
edlib.c first commit 3 hafta önce
edlib.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
edlib.h first commit 3 hafta önce
em.c first commit 3 hafta önce
em.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
extsort.c first commit 3 hafta önce
extsort.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
extsort.h first commit 3 hafta önce
filter.c first commit 3 hafta önce
filter.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
filter.h first commit 3 hafta önce
gff.c first commit 3 hafta önce
gff.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
gff.h first commit 3 hafta önce
gvcf.c first commit 3 hafta önce
gvcf.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
gvcf.h first commit 3 hafta önce
hclust.c first commit 3 hafta önce
hclust.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
hclust.h first commit 3 hafta önce
hex.h first commit 3 hafta önce
khash_str2str.h first commit 3 hafta önce
kheap.h first commit 3 hafta önce
kmin.c first commit 3 hafta önce
kmin.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
kmin.h first commit 3 hafta önce
main.c first commit 3 hafta önce
main.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
mcall.c first commit 3 hafta önce
mcall.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
mpileup.c first commit 3 hafta önce
mpileup.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
mw.h first commit 3 hafta önce
ploidy.c first commit 3 hafta önce
ploidy.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
ploidy.h first commit 3 hafta önce
prob1.c first commit 3 hafta önce
prob1.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
prob1.h first commit 3 hafta önce
rbuf.h first commit 3 hafta önce
read_consensus.c first commit 3 hafta önce
read_consensus.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
read_consensus.h first commit 3 hafta önce
regidx.c first commit 3 hafta önce
regidx.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
regidx.h first commit 3 hafta önce
reheader.c first commit 3 hafta önce
reheader.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
smpl_ilist.c first commit 3 hafta önce
smpl_ilist.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
smpl_ilist.h first commit 3 hafta önce
str_finder.c first commit 3 hafta önce
str_finder.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
str_finder.h first commit 3 hafta önce
tabix.c first commit 3 hafta önce
tabix.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
tsv2vcf.c first commit 3 hafta önce
tsv2vcf.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
tsv2vcf.h first commit 3 hafta önce
utlist.h first commit 3 hafta önce
variantkey.h first commit 3 hafta önce
vcfannotate.c first commit 3 hafta önce
vcfannotate.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfbuf.c first commit 3 hafta önce
vcfbuf.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfbuf.h first commit 3 hafta önce
vcfcall.c first commit 3 hafta önce
vcfcall.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfcnv.c first commit 3 hafta önce
vcfcnv.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfconcat.c first commit 3 hafta önce
vcfconcat.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfconvert.c first commit 3 hafta önce
vcfconvert.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcffilter.c first commit 3 hafta önce
vcffilter.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfgtcheck.c first commit 3 hafta önce
vcfgtcheck.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfhead.c first commit 3 hafta önce
vcfhead.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfindex.c first commit 3 hafta önce
vcfindex.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfisec.c first commit 3 hafta önce
vcfisec.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfmerge.c first commit 3 hafta önce
vcfmerge.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfnorm.c first commit 3 hafta önce
vcfnorm.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfplugin.c first commit 3 hafta önce
vcfplugin.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfquery.c first commit 3 hafta önce
vcfquery.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfroh.c first commit 3 hafta önce
vcfroh.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfsom.c first commit 3 hafta önce
vcfsom.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfsort.c first commit 3 hafta önce
vcfsort.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfstats.c first commit 3 hafta önce
vcfstats.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcfview.c first commit 3 hafta önce
vcfview.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcmp.c first commit 3 hafta önce
vcmp.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
vcmp.h first commit 3 hafta önce
version.c first commit 3 hafta önce
version.c.pysam.c first commit 3 hafta önce
version.sh first commit 3 hafta önce

README 

BCFtools implements utilities for variant calling (in conjunction with
SAMtools) and manipulating VCF and BCF files.  The program is intended
to replace the Perl-based tools from vcftools.

See INSTALL for building and installation instructions.

Please cite this paper when using BCFtools for your publications:

Twelve years of SAMtools and BCFtools
Petr Danecek, James K Bonfield, Jennifer Liddle, John Marshall, Valeriu Ohan, Martin O Pollard, Andrew Whitwham, Thomas Keane, Shane A McCarthy, Robert M Davies, Heng Li
GigaScience, Volume 10, Issue 2, February 2021, giab008, https://doi.org/10.1093/gigascience/giab008

@article{10.1093/gigascience/giab008,
    author = {Danecek, Petr and Bonfield, James K and Liddle, Jennifer and Marshall, John and Ohan, Valeriu and Pollard, Martin O and Whitwham, Andrew and Keane, Thomas and McCarthy, Shane A and Davies, Robert M and Li, Heng},
    title = "{Twelve years of SAMtools and BCFtools}",
    journal = {GigaScience},
    volume = {10},
    number = {2},
    year = {2021},
    month = {02},
    abstract = "{SAMtools and BCFtools are widely used programs for processing and analysing high-throughput sequencing data. They include tools for file format conversion and manipulation, sorting, querying, statistics, variant calling, and effect analysis amongst other methods.The first version appeared online 12 years ago and has been maintained and further developed ever since, with many new features and improvements added over the years. The SAMtools and BCFtools packages represent a unique collection of tools that have been used in numerous other software projects and countless genomic pipelines.Both SAMtools and BCFtools are freely available on GitHub under the permissive MIT licence, free for both non-commercial and commercial use. Both packages have been installed \\>1 million times via Bioconda. The source code and documentation are available from https://www.htslib.org.}",
    issn = {2047-217X},
    doi = {10.1093/gigascience/giab008},
    url = {https://doi.org/10.1093/gigascience/giab008},
    note = {giab008},
    eprint = {https://academic.oup.com/gigascience/article-pdf/10/2/giab008/36332246/giab008.pdf},
}